Вы здесь

Расшифрован геном ели: он в семь раз больше, чем у человека

11 posts / 0 новое
Последняя публикация
Alex Olonen
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 11 months назад
Регистрация: 08/12/2011 - 10:05
Расшифрован геном ели: он в семь раз больше, чем у человека

Расшифрован геном ели: он в семь раз больше, чем у человека, сообщает Газета.ру.

Цитата:
Геном ели обыкновенной (Pícea abies) оказался самым крупным из всех расшифрованных к настоящему моменту — в семь раз больше генома человека. При этом число функциональных генов не намного больше, чем у человека.

Ель обыкновенная (другие названия — ель европейская и даже the Christmas Tree, то есть Рождественское дерево) — всем известное хвойное дерево, которое в России растет от северной границы лесов до южной черноземной зоны. В средней полосе России соседствует с сосной обыкновенной и лиственными деревьями, образуя смешанные леса. В Европе же ель широко распространена на северо-востоке, а вот в западных регионах она встречается только в горах: в Альпах, Карпатах и горах Балканского полуострова.

Ель обладает рядом интересных свойств. Так, она нетребовательна к почвам и отличается высокой теневыносливостью. Ель имеет свойство давать новые побеги-клоны из корней отмерших стволов. Возраст самой старой известной ели с учетом клонов достигает 9550 лет. И это не говоря о том, что в промышленности широко используются легкая и мягкая древесина ели и ее кора. Кроме того, в качестве лекарственного сырья используют шишки: они содержат эфирное масло, смолы, дубильные вещества. Настой почек ели оказывает противомикробное, спазмолитическое и десенсибилизирующее действие: так, отвар и настой шишек применяют для лечения заболеваний дыхательных путей и бронхиальной астмы.

Но даже принимая во внимание все эти важные и интересные качества ели, вряд ли ученые могли предположить, что геном этого дерева окажется самым крупным из всех геномов, которые когда-либо были ранее расшифрованы.

Исследование, результаты которого в ночь на четверг опубликованы в престижном журнале Nature, было проведено ботаническим исследовательским центром в шведском городе Умео (UPSC) и лабораторией науки для жизни в Стокгольме (SciLifeLab). Стоимость проекта составила 70 млн шведских крон ($10,6 млн), что существенно меньше стоимости исследования человеческого генома, составившей 20 млрд крон ($3 млрд).

В общей сложности ученые выявили около 29 000 функциональных генов – больше, чем имеет человек (20 000–25 000 генов по результатам проекта Human Genome Project), и почти столько же, сколько имеет резуховидка Таля (Arabidopsis) – известный модельный организм, как муха дрозофила, птица зебровая амадина и лабораторная мышь.

Но по своим размерам геном ели превосходит геном человека почти в семь раз, а геном резуховидки Таля — в сто раз.

В ходе работы исследователи получили ответ на вопрос, почему так происходит. Геном ели содержит такие фрагменты, которые получили условное название «геном ожирения», — эти фрагменты отображают большое количество повторений последовательностей ДНК, которые накопились в результате сотен миллионов лет эволюции. У растений и животных есть эффективные механизмы по удалению таких повторов, чем не могут похвастаться хвойные.

Самой большой проблемой в проекте было получение около 20 миллиардов «букв» генетического кода в правильном порядке, не запутавшись в повторениях шифра ДНК.

«Представьте себе библиотеку, в которой содержится 10 000 книг толщиной с Библию, но все эти книги написаны на языке, в котором есть всего четыре буквы. И как будто бы кто-то взял 100 копий с каждой из 10 000 книг, отправил это в уничтожитель документов и перемешал. После такой процедуры собрать точные копии каждого заголовка может быть немного проблематично», — поясняет профессор Стефан Янссон из UPSC.

«Мы вынуждены были настроить компьютеры и переписать многие компьютерные программы, используемые в аналогичных исследованиях, для того чтобы справиться с расшифровкой огромного количества ДНК последовательностей», — заявил говорит профессор Йоаким Лундберг из SciLifeLab.

Он отметил, что в данной работе из-за большого объема генома ели был достигнут предел шведской государственной системы по хранению данных, и это была лишь одна из многих практических проблем, которые нужно было решить, чтобы сохранить проект в работе и достичь его успеха.

Результатам данной работы шведские ученые, работающие в области сельскохозяйственных наук, видят широкое применение.

«Новейшие и более эффективные сельскохозяйственные технологии должны быть использованы для того, чтобы 200 миллионов саженцев, высаживаемых каждый год, становились сильнее и здоровее, вне зависимости от того, в каком районе они растут — бедном или богатом питательными веществами, — заявил профессор Уве Нильссон из UPSC. — Лесная промышленность вступает в новую эру, и Швеция обладает потенциалом для того, чтобы быть в авангарде».

Алексей Серов
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 10 months назад
Регистрация: 21/12/2011 - 18:02

Природа - плохой программист. Такой количество лишнего кода! :)

Йожыг
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 10 months назад
Регистрация: 03/05/2012 - 09:33

маленькая рыбка лучше большого таракана.

дерзкий договорщик
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 10 months назад
Регистрация: 21/12/2011 - 20:27

В Швеции уже доигрались в богов, вывели сосну, которая пахнет апельсином.
Слышал, что из-за тонкомеров, которыми во благо промышленности вся страна засажена, из почвы в озера устремилась ртуть. Так теперь местную шведскую рыбу у них беременным женщинам кушать нельзя... Вредная, ртутная...
Вот они, эксперименты... Зато все-цари природы и все такое! :ymdevil:

Chema
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 10 months назад
Регистрация: 02/03/2012 - 15:43

Дерзкий договорщик написал:
В Швеции уже доигрались в богов

И продолжают играть! По итогам этого исследования ученые уже наобещали вывести быстрорастущие елки: https://greenpressa.ru/v-mire/uchenye-poobeshchali-snabdit-lesopromyshlennikov-bystrorastushchimi-elyami

Анна Романова
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 11 months назад
Регистрация: 05/12/2011 - 15:47

Очевидно, на подходе что-то более грандиозное...

Жанна
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 11 months назад
Регистрация: 19/12/2012 - 08:48

Главное не количество, а качество.. :D. И генов в том числе. Наверное. Я, правда, не генетик.

В лесном хозяйстве США, например, давно используют ГМ организмы: выводят сорта лесных пород, не склонных к гниению. И прочими "полезными" свойствами.

Анна Романова
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 11 months назад
Регистрация: 05/12/2011 - 15:47

Я отношусь к тем людям, которые с осторожностью смотрят на такие игры. Сложно быть умнее самой природы.
К трансгенным березкам отношение весьма неоднозначное...

Жанна
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 11 months назад
Регистрация: 19/12/2012 - 08:48

В Беларуси ведутся работы над созданием генетически модифицированных лесных культур
http://www.wood.ru/ru/lonewsid-12421.html

Чт-то нас ожидает...

Yew
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 10 months назад
Регистрация: 18/01/2013 - 04:30

Осталось найти за этим кого-нибудь по типу одиозной Монсанто. Сумасшедший ученый всегда поддерживается кем-нибудь более продуманным и умеющим хорошо считать.
А может быть, как всегда, военные? О_о Елка-убийца?..

Анна Романова
Не в сети
Последнее посещение: 2 года 11 months назад
Регистрация: 05/12/2011 - 15:47

Жанна написал:
В Беларуси ведутся работы над созданием генетически модифицированных лесных культур
http://www.wood.ru/ru/lonewsid-12421.html

Чт-то нас ожидает...

В МарГТУ тоже активно над этим работают. На этом форуме есть отдельная тема по генетически модифицированным лесным культурам.